中国农业科学院深圳农业基因组研究所（以下简称“基因组所”）是中国农业科学院和深圳市共同举办的新型国家级研究所，创办于2014年1月。基因组所入选科技部、中组部等七部委遴选的科技体制改革试点单位。经过7年的发展，基因组所已经初步建立了以组学技术为核心的学科体系，组建组学技术、合成生物学、植物基因组、动物基因组、生态基因组5个研究中心，正在筹建食品科学研究中心；汇聚了包含20余名国家级人才在内的600余人的研究队伍；和海内外大学共同建设中国农业科学院深圳研究生院，培养农业和食品领域的高层次人才；拥有“岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心”“农业农村部基因数据分析重点实验室”和中国农业科学院深圳综合试验基地；在Science、Nature、Cell等顶级杂志上发表SCI论文近300余篇，申请专利100余项，授权专利30项，举办国际农业基因组学大会，奠定了我国农业基因组学的国际地位；2019年、2020年连续两年自然指数排名全国农业类科研院所第一名，多项成果入选“‘十三五’农业科技十大标志性成果”“中国生命科学十大进展”“中国农业科学十大进展”。先后获得“何梁何利基金”奖、“周光召基础科学奖”“深圳经济特区建立40周年创新创业和先进模范人物”“深圳市市长奖”等奖励。